Za wdrażanie Funduszy Europejskich w Polsce odpowiada Ministerstwo Funduszy i Polityki Regionalnej. To jego zadaniem jest koordynowanie realizacji założeń wynikających z najważniejszego dokumentu opisującego, jak i na co w latach 2021-2027 będą przeznaczone Fundusze Europejskie – Umowy Partnerstwa.
Odpowiedzialność w zakresie realizacji funduszy jest podzielona pomiędzy wiele instytucji.
Dla każdego z programów została wyznaczona instytucja zarządzająca. Odpowiada ona za przygotowanie programu oraz zarządzanie nim. Instytucją zarządzającą dla programów krajowych i programów współpracy terytorialnej jest Minister Funduszy i Polityki Regionalnej (z wyłączeniem programu pomocy najbardziej potrzebującym i programu w zakresie rybactwa i morza). Natomiast dla każdego z 16-tu programów regionalnych – zarząd właściwego województwa.
Poniżej lista instytucji odpowiedzialnych za poszczególne programy:
Fundusze Europejskie na Infrastrukturę, Klimat i Środowisko
- zarządzająca:
- Ministerstwo Funduszy i Polityki Regionalnej (Departament Programów Infrastrukturalnych)
- pośredniczące:
- Ministerstwo Klimatu i Środowiska,
- Ministerstwo Kultury, i Dziedzictwa Narodowego,
- Ministerstwo Zdrowia,
- Centrum Unijnych Projektów Transportowych,
- wdrażające:
- Narodowy Funduszu Ochrony Środowiska i Gospodarki,
- Wodnej Instytut Nafty i Gazu - PIB.
Fundusze Europejskie dla Nowoczesnej Gospodarki
- zarządzająca:
- Ministerstwo Funduszy i Polityki Regionalnej (Departament Programów Wsparcia Innowacji i Rozwoju)
- pośredniczące:
- Narodowe Centrum Badań i Rozwoju,
- Polska Agencja Rozwoju Przedsiębiorczości,
- Bank Gospodarstwa Krajowego,
- Ośrodek Przetwarzania Informacji - Państwowy Instytut Badawczy,
- Fundacja na rzecz Nauki Polskiej.
Fundusze Europejskie dla Rozwoju Społecznego
- zarządzająca:
- Ministerstwo Funduszy i Polityki Regionalnej (Departament Europejskiego Funduszu Społecznego)
- pośredniczące:
- Centrum Projektów Europejskich,
- Kancelaria Premiera Rady Ministrów,
- Ministerstwo Edukacji i Nauki,
- Ministerstwo Rodziny i Polityki Społecznej,
- Ministerstwo Zdrowia,
- Narodowe Centrum Badań i Rozwoju,
- Polska Agencja Rozwoju Przedsiębiorczości,
- Bank Gospodarstawa Krajowego,
- Centrum Projektów Polska Cyfrowa.
Fundusze Europejskie na Rozwój Cyfrowy
- zarządzająca:
- Ministerstwo Funduszy i Polityki Regionalnej (Departament Rozwoju Cyfrowego),
- pośrednicząca:
- Centrum Projektów Polska Cyfrowa.
Fundusze Europejskie dla Polski Wschodniej
- zarządzająca:
- Ministerstwo Funduszy i Polityki Regionalnej (Departament Programów Ponadregionalnych)
- pośredniczące:
- Polska Agencja Rozwoju Przedsiebiorczości,
- Centrum Unijnych Projektów Transportowych,
- Ministerstwo Klimatu i Środowiska,
- wdrażająca:
- Narodowy Fundusz Ochrony Środowiska i Gospodarki Wodnej.
Fundusze Europejskie na Pomoc Żywnościową
Ministerstwo Rodziny i Polityki Społecznej
Fundusze Europejskie dla Rybactwa
Ministerstwo Rolnictwa i Rozwoju Wsi, instytucja zarządzająca: Departament Rybołówstwa w Ministerstwie Rolnictwa i Rozwoju Wsi
Pomoc Techniczna dla Funduszy Europejskiej
Ministerstwo Funduszy i Polityki Regionalnej (Departament Programów Pomocowych)
16 programów regionalnych - Fundusze Europejskie dla:
- Dolnego Śląska 2021-2027 - Urząd Marszałkowski Województwa Dolnośląskiego
- Kujaw i Pomorza 2021-2027 - Urząd Marszałkowski Województwa Kujawsko-Pomorskiego
- Lubelskiego 2021-2027 - Urząd Marszałkowski Województwa Lubelskiego
- Lubuskiego 2021-2027 - Urząd Marszałkowski Województwa Lubuskiego
- Łódzkiego 2021-2027 - Urząd Marszałkowski Województwa Łódzkiego
- Małopolski 2021-2027 - Urząd Marszałkowski Województwa Małopolskiego
- Mazowsza 2021-2027 - Mazowiecka Jednostka Wdrażania Programów Unijnych
- Opolskiego 2021-2027 - Urząd Marszałkowski Województwa Opolskiego
- Podkarpacia 2021-2027 - Urząd Marszałkowski Województwa Podkarpackiego
- Podlaskiego 2021-2027 - Urząd Marszałkowski Województwa Podlaskiego
- Pomorza 2021-2027 - Urząd Marszałkowski Województwa Pomorskiego
- Śląskiego 2021-2027 - Urząd Marszałkowski Województwa Śląskiego
- Świętokrzyskiego 2021-2027 - Urząd Marszałkowski Województwa Świętokrzyskiego
- Warmii i Mazur 2021-2027 - Urząd Marszałkowski Województwa Warmińsko-Mazurskiego
- Wielkopolski 2021-2027 - Urząd Marszałkowski Województwa Wielkopolskiego
- Pomorza Zachodniego 2021-2027 - Urząd Marszałkowski Województwa Zachodniopomorskiego
