Interreg Południowy Bałtyk wspiera współpracę transgraniczną pomiędzy regionami nadmorskimi Szwecji, Danii, Niemiec, Polski i Litwy. Program Interact świadczy pomoc ekspercką instytucjom odpowiedzialnym za realizację programów Interreg. Po uzyskaniu zgody od wszystkich państw uczestniczących, programy zostaną przekazane Komisji Europejskiej do akceptacji.
W programie Interreg Południowy Bałtyk, Ministerstwo Funduszy i Polityki Regionalnej pełni funkcję instytucji zarządzającej.